清人入关，攻城掠地，屠戮之惨，人理灭绝，余握管至此几于一字一泪，有不忍书而不忍不书者，明室渡乡，庙堂上下前仆后继，干死如饴，其义烈忠忱直足耀日星而动山河。一一《南明史：义例》
清初大屠杀（仅仅是有正史记载中的一部分），（出处过多的，至多选其中的三处）：
辽东之屠：10万以上，《朝鲜王朝实录》，《清世祖实录》；赵州，不详，《兵部行稿》；济南，不详，《兵部题行》；畿南：5千，《清世祖实录》；曹州，不详，《曹州志》；大同，全城只剩5人存活，《清世祖实录》；朔州，不详，《清世祖实录》；汾州，40万，《清世祖实录》，《汾州志》，《明清史料》；泾县，5万，《明清史料》；扬州，不详（扬州十日大屠杀是真实存在，但《扬州十日记》真伪还不能确定，为了防止被清粉骂，所以写为不详）；嘉兴，50万（后人推测）；江阴，17万2千以上，《江阴守城记》；蒲城，不详，《清世祖实录》；嘉定三屠，5万以上，《嘉定乙酉纪事》；常熟，5千，《海角遗编》；昆山，4万，《归庄年谱》，《昆新两县续修合志》；金华，5万，《浙东记略》，《金华府志》；赣州，20万，《赣县志；平海，不详，《南明史》；邵武，不详；湘潭大屠杀，城中生者不满百人，《湘潭县志》；同安，不详；南昌，10万以上，《江变纪略》；信丰，不详，《西江志》；南雄，2万，《南雄县志》；广州大屠杀（庚寅之劫），一说70万（不可信，出处不明），一说10万以上，40万以下（后人推测）《鞑靼战纪》，《广州市宗教志》《续明纪事本末》；潮州，10万，《平南王元功垂范》；四川大屠杀，40万以上（后人推测，四川在明清交接时，死者在300万以上（一说685万），而被张献忠杀害的至多14万，但其中究竟是哪些死于战乱、瘟疫、饥饿，哪些死于清军屠杀已经很难分辨），《中国人口史》；永昌，不详，《清世祖实录》；潼关，不详，《清世祖实录》。
清军屠杀模式：清军头领发布屠城令，实施集体杀戮，和集体强奸。屠杀后，男子人头筑”京观“，女子“取阴肉或割**，验功之所，积成丘阜”。
顺治二年（1645年）7月30日，清军至沙镇，“见者即逼索金银，索金讫，即挥刀下斩，女人或拥之行淫，讫，即掳之入舟……遇男女，则牵颈而发其地中之藏，少或支吾，即剖腹刳肠。”八壹中文網
顺治二年（1645年）5月9日，“缚其手，介刃于两指之间，曰：从我则完，不从则裂。陶曰：义不以身辱，速尽为惠。兵稍创其指，血流竟手。曰：从乎？曰：不从。卒怒，裂其手而下，且剜其胸，寸磔死。”
清政府的自述：
《清世祖实录》卷十七顺治二年六月丙寅中:“自今布告之后，京城内外，直隶各省，限旬日尽行剃完。若规避惜发，巧词争辩，决不轻贷”。“所过州县地方，有能削发投顺，开城纳款，即与爵禄，世守富贵。如有抗拒不遵，大兵一到，玉石俱焚，尽行屠戮。”