礼仪草草地结束了，李氏朝鲜王朝的时代结束了。按照内附的惯例，朝鲜王室将在不久后离开朝鲜，在汉地已进行安置。不过朱由校倒对这件事没太上心，打算把麻烦直接甩给内阁。
饶是如此，现在的朱由校也并不清闲：一是要考虑朝鲜总督区的架构和总督人选，二是需要判断朝鲜目前的局势。m.jujiá?y.??m
在出海南巡之前，他和内阁都没有想到朝鲜的部分官员会对内附的反抗会如此强烈，也没有想到锦衣卫与军队下手如此的果断与迅速，虽然说从结果来看这是好事，但也不得不承认，这场针对性的大清洗使朝鲜事态大大的复杂化了，远超出先前的预料。
在大明军队的加持下，现在嗯，大明已经牢牢地控制住了朝鲜的中央政府，但对于地方而言大明的管控力度还是较为薄弱的；准确的说，就是在先前李氏朝鲜王朝时期，朝鲜的中央政府对于地方的掌控也并不强，此时的朝鲜是实实在在的“种姓制度”，地方有当地的豪门贵族所掌控，而中央也是个地方大族较量的场所。
而在目前的情况下，大明直接控制了朝鲜中央政府，这对于很多的地方大族来说是利益受损的，一个不好恐怕会弄出不少奉“衣带诏”讨贼的家伙。虽然他们对于明政府没有任何军事上的威胁，到时候朝廷天兵一到，只需万人，顿时就能将其碾为齑粉，但这会是明军陷入到治安战当中，使朝鲜不能成为加油包，反而成为了放血槽，这与朱由校的目的不符；他需要的是一个稳定的，可以为明朝辽东军团作为战略后方和返攻基地的朝鲜。
这使得他不得不延长了自己在朝鲜巡视的时间，并且将彻底控制朝鲜个地区的军队，掌握权，朝鲜的军权，作为首要目标。
虽然朝鲜王朝军队实力弱小是古今中外所有人的共识，但不能不承认，此时的朝鲜还有七支军队仍拥有一定的战斗力，不可小觑，只要稳住了这七支军队，那基本上就稳住了整个朝鲜。
而这七支：军队分别朝鲜六镇兵丁（庆源军镇、会宁军镇、钟城军镇、庆兴军镇、稳城军镇和富宁军镇）和降倭军。
六镇兵马，以骑兵为主力，是李氏朝鲜军中难得的骁勇善战、弓马娴熟的部队，驻扎在北方前线，以防止后金窥视。应当承认这些军队是有一定战力的，曾经与各个女真部落打得有来有回；但是他们并不善火器，在任辰战争中被打得很惨，况且努尔哈赤早已整合了女真，此时若后金主力全面进攻的话，他们的防线至多是延滞罢了，没有丝毫的胜算。
虽然攘外不行，但是朱由校与明廷本来也就没在这方面指望过他们，而单论安内的话，六镇确实绰绰有余。只要六镇在掌握，那整个朝鲜的北方便安稳了。
而剩下的一支王牌便是降倭了，降倭部队最开始就是由万历朝鲜战争中日本降卒所组成的部队，但现在时过境迁，第一批日本士兵早就老了，现在的部队基本上是由其子孙和他们训练的朝鲜士兵组成的，并且知道现在还有相当的战力。