崇祯正端坐在龙椅上，处理着烦心事。他最大的烦心事有三桩、流寇，流寇，流寇。
由于刘明遇这个异世蝴蝶的影响，朝廷任命大陈奇瑜为兵部尚书，节制全国兵马。
更是受刘明遇的影响，他先是平定了土默特部，又占领了鄂尔多斯，河套，从而将洪承畴这个三边总督给解放子出来。
在历史上，三边总督虽然号称拥有九总兵八万七千余兵力，事实上这只是字面上的数字，为了防备关外的蒙古，洪承畴这个三边总督，其实只能调用两三万人马。由于现在他不需要防备蒙古了，关外的蒙古不是被刘明遇打服了，就是被打跑了。
而赵虎坐镇丰州，三边总督反而像宣大总督一样，根本就不用管长城防线，长城防线都被刘明遇自己承包了。
洪承畴也颇有才干，气势逼人。在十分不利的情况下，率部斩一条龙、金刚钻、翻山鹞、黑煞神、人中虎、五阎王、马上飞；王登槐；、马红狼、满天飞；满鹅，擒拿了黄参耀、隔沟飞；张聪、樊登科、樊计荣、一块铁、青背狼、穿山甲、老将军、二将军、满天星、上山虎等人。
陈奇瑜麾下斩扫地虎；扒地虎、括天飞；跳山虎、新来将、就地滚、小黄莺、房日兔；贾总管、逼上天、小红旗；草上飞、一只虎、一翅飞、云里手、四天王、独尾狼，各路农民起义军首领基本上被剿灭。
按说，崇祯皇帝应该高兴，可是由于陈奇瑜错误的判断了形式，陈奇瑜代表明朝廷同义军达成了招安协议：由陈奇瑜按起义军士兵数目，每一百人派一名安抚官加以监视，负责遣返原籍安置；所过府县由当地政府供应粮草；同时檄止官军进兵，以免发生冲突。当时义军开报的受抚人数有四万多名，其中包含八大王部十万三千余人，蝎子块部一万五百余人，张妙手部九千一百余人，八大王又一部八千三百余人。
各部义军并非真正投降，于是整旅出栈道，与陈奇瑜部官兵揖让酣饮，易马而乘，抵足而眠。义军之无衣甲者皆整，无弓矢者皆砺，数日不食者皆得饱腹。义军将士用这种办法巧妙地渡过了难关。就在一天夜间，义军尽数绑缚诸安抚官，或杀、或割耳、或杖责、或绑缚之后而丢之路旁，安抚官死者五十余人。起义军继而攻掠宝鸡、麟游等处，开始纵横而不可制。陈奇瑜这时才如梦初醒，自知闯下了大祸。
义军刚刚反叛时来到凤翔，哄骗驻军打开城门，守城的士兵知道他们是在诈骗，就骗说用绳索拉他们上去，杀死了先上去的三十六个人，其余的义军一哄而走了。他们进犯宝鸡，也被知县李嘉彦挫败。陈奇瑜就弹劾李嘉彦及凤翔乡官孙鹏等杀降激变，破坏了招安的事局，抚按官也对招安怀有二心。崇祯帝不了解实际情况，又因这次招抚是自己批准的，看到陈奇瑜的奏疏后十分恼怒，严厉批评了抚按官，逮捕了李嘉彦、孙鹏，及士绅、百姓五十多人。
原本铜墙铁壁一般的防线竟开始出现漏洞了，流寇进犯中原之势愈演愈烈。随着陕州、郑州攻克下，水陆并进，经过长达一个月的激战，竟拿下逼近了洛阳。