可是黄泉洪灾只是开始，紧接着古荒州上瘟疫肆虐，伏羲却无论如何不肯再让神明下界救世，眼看着从洪灾中侥幸活下来的生灵又在瘟疫中大批死去，女娲已经能隐隐感到世界崩塌的颤动。
伏羲始终不肯松口，女娲最后只得同意神农偷偷下界的请求，她用自己的力量将神农送去了古荒州，此事被伏羲发现后引得伏羲大怒，面对与自己长久相伴的女娲，伏羲无法处罚她，可对于神农伏羲却毫不心软，不管女娲如何恳求，伏羲依然将所有的怒火倾泻在了神农身上，他不但将神农的名字从神碑上划掉，让神农从此失去了祖神的承认，无法再回到神明的世界，还彻底封闭了九天神界，任何神灵，包括女娲也无法私自穿过伏羲祖神的设下的结界，九天神界彻底与三千世界断绝了联系。
女娲对此心急如焚，她此前顾忌伏羲越来越暴虐的脾气未曾将预示之事直言，此时却也顾不得那么多了，她将两次预示中的消息尽数告诉了伏羲，原意是希望伏羲能收回成命，重新将九天神界与三千世界互相联系，然后与众神一起扭转神灵对世界的伤害，谁料伏羲听闻此事后怒意滔天，他认为天道与三千世界皆是忘恩负义之徒，三千世界诞生之初的一切都来自于祖神，天道亦是他一点点制定，可如今天道却应和了三千世界的意志，要将神明排斥出三千世界之外，这在伏羲看来完全不可饶恕。
面对女娲的请求，伏羲毫不犹豫地拒绝了，他傲然道：“汝之方式，置吾等何地？彼欲弑神，吾当杀之。”
女娲惊问：“汝欲如何？”
“灭世，重生。”
这四个字伏羲说得斩钉截铁，女娲立刻便察觉伏羲恐怕早有此意，天道一事让他彻底下定了决心，女娲忽然明白过来，哪怕她贵为祖神，高高在上，拥有翻云覆雨的强大力量，却依然无法掌控未来，她所做的一切并没有扭转未来的走势，反而促成了伏羲灭世的决定。
预示中天崩地裂的场景犹在眼前，女娲心头无比沉重，她有种强烈的预感，哪怕伏羲真的灭掉了三千世界，他设想的神明统治的未来也不会到来。
女娲重新开始了对那两个预示的研究，她甚至动用了自己最本源的力量去推算，希望在神明与三千世界之间寻得可以两全的生机。
也许世事皆是死地亦有一线生机，女娲苦苦推算后终于抓住了一缕曙光，虽然这个结局对于众神来说依然不甚美好，但神明的生命是那样漫长，暂时的退却换来一个皆大欢喜的未来未尝不是一种方法。
只是女娲清楚伏羲不会同意这样做的，他身为祖神的骄傲绝不会允许他在自己亲手制定的天道面前退却，而女娲又不可能真的与伏羲决裂，若是两位祖神先打起来了，三千世界都不够他们毁灭的，其余诸神更不用说了，有了神农的例子在先，如今众神都以伏羲马首是瞻，再不敢生出一点别的心思来。