顾长风归降后，明廷水军投降了。
这一战，雪千寻所率领的日月神教水军完胜，战损微乎其微，而明廷水军也被打服了，投降之后都老老实实呆着，听候发落。
而接下来整编明廷水军的事情，林飞也不打算理会了，全权交给了顾长风处理。
顾长风见此，深受感动，他本以为自己要跟明廷水军告别，但没想到林飞竟然如此信任他，还继续让他统率这一支前明的力量。
于是乎，顾长风接下来便大刀阔斧进行改变明廷水军，清点兵员，砍掉空饷，发钱遣散所有老弱病残以及不愿意继续打仗的兵士，只保留一些精锐。
一番裁减之后，原本在编一万人的明廷水军队伍，活生生被顾长风裁减成两千人。
另外，那田启云看到明廷大势已去，自己又没什么本事，便弃甲归田，回乡下当农夫去了。
自然，顾长风重整水军之时，曾向林飞请示新军之名。
林飞不假思索便给出了“黑旗军”一名，并嘱咐道：“将来你带的这支新军，不仅仅要在水上能打，而且在岸上也能打，将来以黑旗为你们的旗帜，让天下都传播你们的威名。”
得到了林飞的训示，顾长风更是深受感动，接下来愈加用心去训练黑旗军。
而林飞在明廷水军营寨住了一晚，大概参观了一番明廷水军营寨过去打造的各种玩乐设施，随后便率领着日月神教水军离去。
接下来林飞要去跟任我行进行汇合。
八闽之地的明廷势力、海盗势力，在任我行跟百姓的联合之下，全部覆灭。
因为这一次有百姓的参与，各地的日月神教教众，为了避免滥杀无辜，惹恼了林飞，所以基本上是遇到反抗就杀，投降就抓。
于是乎当初高高在上的那些豪绅巨贾族人，以及各级官员，此刻都沦为阶下囚，每时每刻都遭遇愤怒的百姓的各种报复，被折磨得那一个叫凄凉。
数日后。
林飞在同安县登陆，而任我行也率领着一大批日月神教教众，在港口亲自迎接林飞。
“恭迎主君，主君万岁，万岁，万万岁！”
林飞带着东方白跟雪千寻刚下旗舰，码头上黑压压的一大片人统统跪下来，朝着林飞山呼万岁。
对此，林飞却也颇为满意，朝那任我行道：“任我行，八闽之地，往后就由你来治理，日月神教的总部，以后也迁到这里来吧。”
“属下遵命。”任我行恭敬道。
“还有这日月神教的水军，也是时候回归了，雪千寻以后你就跟仪琳一起统率娘子军吧。”林飞看向一旁的雪千寻。
既然雪千寻跟了林飞，那接下来不可能再带领着一支舰队继续南征北战。