一年时间匆忙而过，在一年的滞留时间里，萧然足足花了一个月时间才让自己重新恢复过来，事实上在第一个星期过去，萧然就已经可以离开轮椅自由行动，哪怕是使用念动力都没有什么问题，只是这次的透支比起以往任何一次都要更为严重，颇有一种伤到了本源的感觉，在精神力的运用上都有些干涩没有以前那么运转自如，总仿佛有些什么东西在影响着萧然的精神里一样，用差不多一个月的时间进行调养，休整，逐渐的才重新恢复过来，而且还让萧然的精神力差不多又涨了十分之一的样子，这应该算是塞翁失马焉知非福还是说大难之后必有后福？
萧然用一年的时间来对整个军团内部进行了改革，不只是针对参与者，参与者这方面的改革反倒是最小的，因为参与者尊崇的是普罗米修斯的规则，而这个规则已经相当的完善，算是军团的对外部分。
主要进行改革的是军团内部，重新进行一个大的规整什么的，所包括的内容是方方面面，总之是萧然一句话下面忙死人，变革工作在其中起到主导作用的人也并不完全是军团的参与者高层，真正在布置的人则是各个世界的军团非参与者高层，比如说0079世界的雷比尔，革命机世界的凯恩，SEED世界的拉克丝，卡嘉莉，船团世界的凯瑟琳这些人。
萧然真正重视的只有三块，第一技术部门，第二基因部门，第三军事改革部门，真正需要萧然操心的也就只有这三个部门而已。
技术部门有罗做主导安排，整合内外资源进行了新的模式更改，分为第一至第六主要研究所，然后从第七到五十次要研究所，以及更多的外围研究所组成，每一个研究所下都下属多个部门，同时也有多个研究小组，会根据不同任务来安排不同的所，部门，小组来负责。
同时每个研究所也有主要专攻项，第一研究所负责真实系机体研究，第二研究所负责超级系机体研究，第三研究所主要负责战舰，第四研究所则是多元世界研究这样，而次要研究所如果开启重要项目的话，也可以晋升为主要研究所。
次要研究所主要负责不那么着急重要的技术任务，比如材料研究，能源研究，同时也需要配合主要研究所来进行工作，这样一来也算是对整个技术部门完全的规则化和细分化。
基因部门的改动并不多，只是完全在内部确立了不同的项目部，比如铁加曼项目部，血脉血清项目部，拉达姆兽项目部等等，当然也还有其他的部门存在同样进行了较为精细的分工。
至于军事改革部门，则属于军方的一个具体改革指导研究办公室，调研现在军方军事武装的改革方向，新型装备配发和旧装备的回收，优秀人员的定向培养等等，但现在大部分精力则是放在了调研新型战舰，全新要塞建立计划以及人员培养上面。
要在如今已经非常庞大的军团进行改革，一年的时间肯定是不可能完成的，所以现在的改革工作只能说是有了初步的进展。